可视区域图片加载_HiC数据可视化浏览器知多少

三维基因组学技术的日新月异带来了后基因组时代——功能基因组的极速发展，借助三维基因组技术，研究者可以进一步探究非编码基因组区域的改变对染色质相互作用和对基因表达的影响。而Hi-C数据量大，互作矩阵的构建复杂，如何可视化Hi-C互作数据，是非生信专业研究者的迫切需要。

三维基因组浏览器可real-time可视化，高效且便利。一方面从全基因组层面更加直观地展示三维组学数据，还可结合其它组学数据进行多组学联合展示；另一方面从目标区域的可视化结果中可及时地挖掘有效信息。

想必大家都或多或少了解或使用过Integrative Genomic Viewer(IGV)和UCSC Genome Browser，适用于三维基因组数据可视化的浏览器也层出不穷，多款三维基因组浏览器也各有各的特点(Table1)[1]。

Table1 三维基因组浏览器简介

3Disease Browser

3Disease Browser由李程课题组开发，该浏览器关注并可视化与疾病相关的染色体重排(Chromosomal rearrangement，CR)事件的三维基因组结构[2]。通过SI (Structure Influence) score计算与疾病相关的CR事件对基因组三维结构影响，筛选潜在的因改变三维结构改变而致病的CR。通过检索基因或疾病名称，可以看到：

①该CR事件附近区域在不同细胞系样本中的互作热图、TAD边界、组蛋白修饰、基因注释等信息。

②该疾病的相关基因。

③该CR事件附近区域的局部三维结构。

Figure1 3Disease Browser可视化界面

(点击放大)

ChromContact

ChromContact浏览器界面友好、操作简便，可直接链接到UCSC Genome Browser进行可视化展示[3]。通过检索基因、SNP或基因组位置