因为10X仪器的商业化成功,目前大家的单细胞转录组课题基本上都是10X数据,所以我在单细胞天地分享了一系列相关教程,希望可以接地气的帮助大家,如下:
也有从建库测序的fastq数据走cellranger流程的详细教程,如下:
得到表达矩阵标准3个文件,再走前面的下游分析教程。不管是上下游,都是数据分析阶段了,难道你不感兴趣你分析的数据是如何产生的吗?
联川生物的单细胞组织消化解离的详细步骤视频
圈内好友推送了联川生物的单细胞组织消化解离的详细步骤视频,希望本视频能够给那些在组织消化和单细胞悬液制备遇到困难的实验室小伙伴以启示,部分细节镜头停留时间较长。
本视频以10×Genomic平台的单细胞转录组为例,涉及的主要实验步骤都记录在了视频中,步骤包括
文献资料查询,样本解离方案确定;
样品接收(样品接收时的温度检测记录);
组织解离器具准备;
组织剪切和清洗(去除血渍等,剪切程度,过筛);
酶液中组织的消化(组织转移,水浴,计时,中间观察);
离心收集细胞(离心);
去除死细胞提高细胞活率;
自动化细胞技术仪对细胞进行计数;
10×芯片进样操作和上机操作
生成的GEM(油包水)转移回收
视频获取方式
在单细胞 天地后台回复 实验 即可拿到视频
还有一个惊喜
联川生物即将上市的工具书《单细胞测序一本通》的第五章,会有将近50页的篇幅为大家详细描述组织解离和单细胞悬液制备的各种细节。
另外告诉大家一个好消息,联川生物的《单细胞测序工具书》已经新鲜出炉少量,大规模印刷正在紧急进行中。
领取方式
想在新书上市第一时间内拿到本书的朋友,在单细胞天地本推文的留言区集赞即可,总赞数量超过38的前8名可以拿到联川生物的《单细胞测序工具书》,小编会联系符合资格的8位朋友提交收货地址。
活动截止时间:2020年1月9日17:30。
我们单细胞天地有数据分析的完整文字版教程了
第一单元:文献背景及课程介绍
第二单元:常规转录组基础知识回顾
第三单元:单细胞3大R包的学习
第四单元:重复文章图表
第五单元:结合公共数据库
第二期单细胞视频笔记汇总
免疫治疗
发育
单细胞基因组
其它R包及笔记