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cell ranger输出结果目录结构如下所示
├── analysis
│ ├── clustering
│ ├── diffexp
│ ├── pca
│ └── tsne
├── cloupe.cloupe
├── filtered_feature_bc_matrix.h5
├── filtered_gene_bc_matrices
│ └── GRCh38
├── metrics_summary.csv
├── molecule_info.h5
├── possorted_genome_bam.bam
├── possorted_genome_bam.bam.bai
├── raw_feature_bc_matrix
│ ├── barcodes.tsv.gz
│ ├── features.tsv.gz
│ └── matrix.mtx.gz
├── raw_feature_bc_matrix.h5
└── web_summary.html
输出文件非常的多,为了方便查看结果,提供了一个所有结果汇总的html
页面,即web_summary.html
。该网页的结果分成了summary
和analysis
两部分, summary
部分包含如下结果
1. 异常结果警告
如果数据中存在异常,在网页的头部会给黄色的警告框,如下所示
点击Details
, 可以看到详细的信息,上图显示RN