tcga数据下载_R语言简单学(TCGA数据下载)

提起R语言,貌似很艰难

图文一结合,傻瓜都能填

一、打开R程序

1e10967369e6b9c0e2b6998f54d4c802.png

> chooseCRANmirror()

56ce84d22568e426629799c57a345b1a.png

> BiocManager::install("TCGAbiolinks")

99acd4d226a1e8770ef2987e2e68590a.png

更新

> library(TCGAbiolinks)

library(dplyr)

library(DT)

library(SummarizedExperiment)

以宫颈癌CESC为举例:不同的癌症类型只需要替换名称

downlod clinical step:

> cancer_type="TCGA-CESC"

> clinical </

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