tcga数据下载_手把手教你用R语言下载TCGA数据：UCSCXenaTools

最新推荐文章于 2024-10-24 10:25:26 发布

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文章标签： tcga数据下载

本文介绍了如何使用R语言的UCSCXenaTools包下载TCGA数据，详细讲解了从安装包到筛选、下载及数据导入的步骤，帮助读者掌握通过编程方式获取TCGA数据的方法。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

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各位科研芝士的朋友，大家好，今天我们继续分享关于TCGA数据下载的专题，之前给大家推出了四个推文，全部是无代码进行数据下载，如果我们想进一步提升自己的水平，那我们从今天开始，开启R语言编程下载TCGA数据教程推文。还记得它吗？

UCSC-XENA

或许你看了之前的推文，了解到了该网站，甚至亲自操作了一番，你这个时候或许会说，这种感觉不正是像极了爱情吗？

今天，我们学习一下，基于UCSC-XENA开发出的R包UCSCXenaTools.

在提到UCSCXenaTools该包的时候，我们或许需要了解一下该包的前身XenaR包，这个包提供了一个简单的UCSC Xena接口，可以获取一些UCSC Xena存储的信息，包括GDC、TCGA、ICGC、GTEx、CCLE等数据库的上千个数据集。特别是TCGA（hg19版本）的一部分数据UCSC做了非常好的标准化处理，但是有将近四年没有更新，UCSCXenaTools便是在此基础上开发出来的

1. UCSCX