在linux下运行qiime,科学网-QIIME2在Linux环境下的安装-肖斌的博文

第一步：下载Miniconda，Linux下载到的文件是Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh，直接sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh进行安装，

成功后，试了一下直接运行Python，报错信息提示

AttributeError:module'enum'has no attribute'IntFlag'

检查后，发现是原配置环境设置了export PYTHONPATH=/usr/lib/python2.7/site-packages/，修改后你安装Miniconda，运行OK

第二步：更新一下conda

conda update conda

第三步：

此步会下载很多东西

第四步：

source activate qiime2-2017.6

第五步：

qiime --help

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