tcga数据下载_TCGA数据下载与ID转换

今天继续我们的TCGA数据分析系列。

TCGA数据下载

TCGA数据下载的方式有很多，本次我们利用UCSC Xena数据库下载数据.该平台内置了一些公共数据集，比如来自TCGA, ICGC等大型癌症研究项目的数据，不仅可以对数据进行分析，而且还提供了对应文件的下载功能。

打开后界面是这样的

点击DATA SETS，里面有很多数据集，我们选择TCGA肝癌数据

接着我们选择HTSeq-Count

这里可以看到值log2（count+1），为什么加一呢，因为很多基因的表达值是0，无法取log。