一、实时荧光定量PCR概述
1.实时荧光定量PCR的概念
实时荧光定量PCR是指,使用荧光探针标记PCR产物,利用荧光信号积累从而对PCR反应进行实时监测的过程。以反应时间内DNA的增量为基础,能够对DNA进行定量分析。荧光定量PCR简称:RT-qPCR(注意不是反转录PCR(RT-PCR))。
2.相对定量与绝对定量
(1) 相对定量相对定量是指,测定目的基因在两个或多个样本中相对内参基因的表达水平,不需要知道其在每个样本中的拷贝数。可用未处理样品或某一时间样品作参照,无需做标准曲线。
(2) 绝对定量绝对定量是指,测定目的基因在样品中的拷贝数。必须使用已知拷贝数的标品,必须做标准曲线。
3.实时荧光定量PCR的化学基础
(1) SYBR Green I染色法:信号强度和dsDNA浓度呈正比SYBR Green I染料能够与任何dsDNA的小沟非特异性结合,每形成一条双链,就有相应染料与之结合,产生荧光信号,因此荧光信号的积累与PCR反应过程完全同步。
优点:成本低,不必设计复杂探针,适合初步筛查。
缺点:无特异性,不能进行多基因筛查,每个反应只能检测一个目标基因,且结果易受非特异性引物或引物二聚体影响,易产生假阳性。