宏转录组方法_技术贴 | 宏基因组 + 宏转录组分析工具：HUMAnN

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HUMAnN(全称HMP Unified Metabolic Analysis Network)最早由CurtisHuttenhower团队针对HMP项目开发的一款可对宏基因组/宏转录组测序数据进行物种分类分析和功能(代谢)分析的多功能软件【1】

一. HUMAnN 第一版 2012

Curtis Huttenhower团队使用该方法还特意分别做了口腔、粪便宏基因组与宏转录组关系的研究【2】。该研究于2014年发表于PNAS，他们发现：

1)冷冻、乙醇、RNAlater三种保存条件中的微生物群落、宏基因组和宏转录组高度一致。不同保存方法对标本内的生物学信息影响不大。

2)口腔微生物能进入肠道并存活下来的数量很少、转录活性也很低。口腔和肠道的环境差异很大，人体微生物中能同时适应两种环境的数量很少；

3)宏基因组和宏转录组中的生物功能在有很高的一致性【下图】；