r语言热图对列不进行聚类_最简单最实用的R语言热图绘制教程

作者：生信札记

来源：简书

准备数据，最简单粗暴的方式，从Excel中复制，

此时，这个基因表达矩阵已经存放在电脑的剪切板中，回到R语言运行环境，输入(如果是直接复制下面这行代码，那么注意，复制代码的同时已经替换了剪贴板内容，此时黏贴代码之后不要回车，先回去Excel重新复制表达开矩阵)Exp

注意，所有字符都是外文的，如果出错，注意是不是 横杆 在复制代码的时候被转码成 中文的，自己输入就没问题。

此时你只需要第三行代码，就可以输出一张可以看的热图pheatmap(Exp)

一般情况下，我们需要相对基因进行标准化pheatmap(Exp,scale="row")

列的顺序是时间序列，我们不应该对列进行聚类pheatmap(Exp,scale="row",cluster_cols=F)

配色似乎也不好看，pheatmap(Exp,scale="row",cluster_cols=F,color = colorRampPalette(c("navy", "white", "firebrick3