vbn中使用的3种流程控制结构是_细菌进化树构建:从模式种序列下载到构建系统发育树一键搞定...

本文介绍了一套一键化细菌进化树构建流程,从16S序列拆分、比对到NJ和ML树的构建,适用于批量处理和新种新属判断。流程依赖Python3、blast等工具,需自行安装。提供了详细配置和运行说明。
摘要由CSDN通过智能技术生成
0bb0f99a90c8fede30640117cf8f032a.png

菌进化树

细菌进化树构建:从模式种序列下载到构建系统发育树一键搞定

对于细菌新种或者新属的发现,总是那么让人期待,但是当我们批量获得16S序列后,逐一对这些尚不知分类地位的序列进行比对并建树验证的过程,着实需要花费不少时间和精力,那么有没有什么方法可以一键批量构建系统发育树帮助我们判断细菌分类地位呢?答案是肯定的,今天就给大家分享一套一键化细菌建树流程,同时流程可提示是否为新种或者新属(提示:本文实操需要读者有一定的linux基础)。

流程下载链接请于公众号后台回复:细菌进化树流程,以获取下载链接~

3a109d172cb9ef743306c0c8ba17d78a.png 064778a463006083003dcc4ef61dc4a7.png 047a2a28d311dc1ee8736527720132f4.png

流程思路

01

90efe4abd4498c11ede5f128ac7c15ae.png
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值