基因芯片(Gene Chip)是一种生物芯片技术,通过高密度固定核酸探针(如寡核苷酸、cDNA等)于基片表面,利用与标记样品的靶核酸杂交检测信号,从而实现基因表达、突变、多态性等信息的高通量分析。以下是关于其核心内容的详细解析:
一、技术原理
- 工作机制:基于DNA互补配对原则,通过探针(由已知核酸序列构成)与靶序列杂交产生信号,再通过荧光或放射性标记量化检测结果。例如,Affymetrix公司的光引导原位合成技术可实现高密度探针排列。
- 关键步骤:
- 探针制备:通过原位合成(如Affymetrix技术)或点样法(如微量点样技术)固定探针。
- 样品处理:提取靶核酸(如mRNA逆转录为cDNA),并用荧光标记后与芯片杂交。
- 信号检测:通过激光共聚焦显微镜等设备读取杂交信号,分析基因表达或序列差异。
二、技术分类
- 按探针类型:
- 寡核苷酸芯片:固定短序列寡核苷酸,用于基因表达谱分析。
- cDNA芯片:固定cDNA片段,用于比较不同样本的基因表达差异。
- 按制造工艺:
- 原位合成芯片(如Affymetrix产品):通过光引导合成技术实现高密度探针。
- 点样芯片:利用微量点样技术将预制探针固定于基片。
三、应用场景
- 基础研究:
- 基因表达分析:如人类HT-12表达谱芯片用于阿尔茨海默病(AD)的差异基因筛选。
- 多组学研究:基因芯片可同步检测基因序列、甲基化及SNP状态,揭示细胞功能。
- 临床医学:
- 疾病诊断:基因芯片用于癌症基因表达谱分析、药物靶点筛选。
- 个性化医疗:通过基因组多态性分析指导用药。
- 农业与育种:
- 动物育种:如猪育种中利用基因芯片筛选1000个QTN标记位点,提升育种效率。
- 工业与环保:
- 药物研发:加速新药筛选和疗效评估。
- 环境监测:检测污染物基因标记。