。
有很多方法可以在R语言中完成KEGG富集分析。这里是一个简单的代码示例:
library(clusterProfiler)
library(KEGG.db)
# 读取基因列表
geneList <- c("gene1", "gene2", "gene3")
# 进行KEGG富集分析
result <- enrichKEGG(geneList, organism = "hsa")
# 打印结果
head(result)
这个代码使用了clusterProfiler
包和KEGG.db
包。首先,读入基因列表,然后使用enrichKEGG
函数进行KEGG富集