量子力学/分子力学(QM/MM)方法
量子力学/分子力学(QM/MM)方法是一种将量子力学(QM)和分子力学(MM)相结合的计算方法,旨在处理包含大量原子的大分子体系。在传统的量子力学方法中,计算资源和时间限制使得处理大分子体系变得非常困难。而分子力学方法虽然可以处理大量原子,但其精度有限,无法准确描述电子结构和化学反应。因此,QM/MM 方法通过在体系中将关键部分用量子力学方法计算,其余部分用分子力学方法处理,实现了计算效率和精度的平衡。
1. QM/MM 方法的基本概念
QM/MM 方法的基本思想是将研究体系分为两个部分:量子力学区域(QM 区域)和分子力学区域(MM 区域)。QM 区域通常包含感兴趣的分子或反应中心,用量子力学方法进行精确的电子结构计算;MM 区域则包含环境分子,用分子力学方法进行快速的动力学模拟。这两个区域通过特定的耦合方法进行相互作用,确保整个体系的计算结果准确可靠。