rdkit&openbabel | 保持化学分子的互变异构一致性

已于 2022-07-11 11:51:25 修改
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分类专栏： AIDD | CADD | 化学 | 生物 文章标签： 大数据
于 2021-08-22 17:59:43 首次发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_43236007/article/details/119837460
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通过使用openbabel将不同SMILES表示的相同化合物转化为InChI，然后重新转换回SMILES，可以确保化学分子的互变异构一致性。这种方法特别适用于处理包含复杂异构体的数据。
摘要由CSDN通过智能技术生成

可以使用openbabel 将表示相同化合物，不同smiles转化为InChI，然后再转回相同smiles来保持异构一致性

from openbabel import pybel
product ="OCC(N=C(O)c1cccc(O)c1O)=C(O)O"
pybel.readstring('smi',product).write('smi',opt=<
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rdkit&python | 挑选多个互变异构体的主要构象
ASKCOS博客
08-21 459
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MOL
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袁家瑜的博客
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