对使用misa得到叶绿体基因组SSR的结果进行注释

对使用misa得到叶绿体基因组SSR的结果进行注释

关于叶绿体基因组的文章中，SSR的鉴定是一件常做的分析，文章中往往会列出每个ssr所在的基因组的位置信息，如：在某基因处，在内含子区域，或者在基因间区，那么这些信息是怎么得到的呢？
诸如此类的信息：

SS1	p2	(TA)6	12	9662	9673	IGS(trnR-UCU,atpA)
SS1	p1	(A)11	11	12336	12346	atpF(intron)
SS1	p2	(TA)5	10	19614	19623	rpoC2

手填的话是可以实现的，但是比较麻烦，如果数量多的话是个很大的工作量。所以可以使用脚本代替我们做这件事情。

实现原理很简单，只需要记录genbank中基因的位置，然后把该信息映射到每个ssr所在的位置就可以了。
需要脚本的小伙伴可加群获取哦~ 群号：636121790