基因组分型是肝癌精准医学的起点[a]
随着2001年人类基因组计划的完成,从基因组维度解析生理和疾病状态下的生物学过程,精准肿瘤学和个体化医疗概念由此诞生。肝癌的发生是一个复杂的多因素多步骤过程,约80%的患者在慢性致病因素(如肝炎、药物性或酒精性)影响下获得不同的病理、基因组及微环境改变,逐步过渡形成硬化结节最终发展为肝癌[24]。高通量基因组分析等技术的发展使我们对肝癌发生发展机制以及患者分子分层有更深入认识,也是肝癌精准治疗的基础和开端。
以基因组、转录组和临床特征为核心的肝癌分子分型[a]
肝癌基因组主导肿瘤驱动模式以及临床病理特征,目前已有超过千例肝癌患者的基因组被测序和分析[25-32],发现肝癌中的高频突变的驱动基因包括TERT(44%的肝癌肿瘤中存在突变)、TP53(31%)、CTNNB1(27%)和ARID1A(7%); 拷贝数分析揭示了28个高频局灶性扩增,包括已知的癌基因CCND1、FGF19、MYC、MET、VEGFA和MCL1[33]。通过整合病因、突变谱、表达谱、临床特征等信息,多项研究中提出了将肝癌患者分为增殖型和非增殖型[24, 34-35],其中增殖型与HBV感染相关且预后较差,表现为细胞增殖和生存相关通路的激活,如PI3K-AKT-mTOR、MAPK和MET级联通路等,进一步可将增殖型肝癌细分为2个亚型: S1类表现为WNT-TNFβ激活; S2类表现为WNT的非经典激活以及高表达EPCAM和AFP。非增殖型患者侵袭性相对较低预