quickGO:在线查询GO和GO注释信息的网站

最新推荐文章于 2024-05-13 14:40:24 发布
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quickGO是EMBL-EBI发布的网站，通过该网站，可以快速的查询Go Terms和Go注释相关信息，官网如下

https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/

通过首页的搜索框，可以快速进行检索。

在搜索框中可以输入3种类型的信息

  1. GO number

  2. GO name

  3. gene product

检索时支持自动联想，可以根据输入数据自动匹配相关的GO和基因产物信息， 示意如下

对于Go Terms 而言，在检索结果中包含以下几种信息

1. Overview

展示每个GO Terms的编号，名字，详细的描述信息，所属分类等基本信息。

2. Ancestor Chart

展示该Go Term到根节点的结构，示意如下

最低0.47元/天 解锁文章
go分析和kegg分析_利用g:profiler基因注释网站进行GO注释分析
weixin_42303282的博客
12-31 2821
由于本人个人的一些原因，距离上次更新文章已经有很长时间了。在此向大家说一声抱歉。之前有关GO注释的文章里，有读者咨询，是否有批量查找基因GO注释的方法。本期，本人就给读者推荐一个非常实用的，完成基因GO批量注释的网站。 david在本人入行期间可谓称霸一方，目前搜索应用david网站（链接：https://www.molecularecologist.com/2016/05/poo...
AmiGO2:在线浏览和查询GO信息的利器
weixin_30455067的博客
12-15 1218
GO数据库的信息是非常庞大的，为了有效的检索和浏览GO数据库的信息，官方提供了AmiGO, 可以方便的浏览，查询和下载对应信息，官网如下 http://amigo.geneontology.org/amigo/landing Broswer功能，采用树状结构，提供了GO的层级分类信息，示意图如下 鼠标单击某个对应的分类，会弹出如下对话框 点击Term的链接，可以查看该层...
GO功能注释-简单快速
weixin_30735745的博客
03-29 4609
参考：https://www.cnblogs.com/xiaojikuaipao/p/7190779.html https://blog.csdn.net/ygyxl/article/details/79742751 GO 注释主要有两种方法：序列相似性比对（BLAST）和结构域相似性比对（InterProScan） 1. 将基因序列与swiss-prot蛋白质数据库进行 BLAST ...
GO功能注释条目图
ziixiaoshenwang的博客
02-04 4649
> go <- read.csv("go.csv",header = T) #Go 条目一般只选择最显著的前10个或20个Term来绘图# > head(go) Ontology 1 Biological process 2 Biological process 3 Biological process 4 Biological process 5 Biological process 6 Biological process .
GO注释步骤（含批量）
weixin_58269397的博客
03-31 1253
注意：这些文件是制表符分隔的文本文件，千万不要保存为 Excel 格式，以免有后续问题！直接整理 eggNOG-mapper 的结果，输出几个文件，分别满足不同下游分析需要。但是使用EBI的工具时是有的（存在报错）2.Gene Onotoloy注释信息。四个文件的具体信息，截图可看。下面2种方法选一种使用即可。的注释结果中没有GO注释。接下来进行数据整理与画图。3.KEGG 注释信息。4.PFAM 注释信息。1.具体功能描述信息。
国外生物信息中心网站
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03-02 1332
生物信息学 1 EBI---欧洲生物信息学研究所；http://www.ebi.ac.uk/ 2 EMBnet---欧洲分子生物学信息网；EMBnet 3 EMIL----欧洲分子生物学实验室；Heidelberg | EMBL.org 4 NCBI----美国国家生物继续信息中心；National Center for Biotechnology Information 5 NCGR----美国国家基因组资源中心；National Center for G...
ArrayExpress数库简介
庐州月光的博客
08-07 3440
欢迎关注”生信修炼手册”!和GEO数据库类似，ArrayExpress是属于EBI旗下的公共数据库，用于存放芯片和高通量测序的相关数据，网址如下https://www.ebi.ac.uk...
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