使用STAR-fusion进行融合基因的分析

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STAR是目前主流的RNA-seq比对软件之一，而STAR-fusion就是一款基于STAR比对结果进行融合基因鉴定的软件，该项目的地址如下

https://github.com/STAR-Fusion/STAR-Fusion/wiki

在对应的文献中，将STAR-fusion与其他融合基因分析软件进行了比较

1. 运行时间

从上图可以看出，STAR-fusion的运行时间有明显优势。

2.  ROC曲线

ROC曲线用于评估软件分析结果的好坏，横坐标为false positive rate, 简称FPR,代表分析结果的假阳性率，纵坐标为true positive rate, 又称之为敏感度sensitivity。对于一个理想的分析结果而言，肯定是假阳性率越低越好，敏感度越高越好。

在ROC曲线中，在曲线下的面积称之为AUC值，一个软件的AUC值越大，则其综合效果最好。

从上图可以看出，对于文章中的测试数据，STAR-fusion的分析结果较好。

该软件的安装比较简单，直接下载文件，解压缩即可，其运行过程如下