Broad GDAC:TCGA数据分析中心

本文介绍了 Broad GDAC 对TCGA数据的深度分析,包括临床、拷贝数、甲基化、miRNA、mRNA等多个方面的关联研究。读者可以访问相关网址获取数据和分析结果,例如Adrenocortical carcinoma的实例展示了各组学数据的关联分析。 Broad GDAC 提供了丰富的数据挖掘工具和方法,适合生信研究者参考。
摘要由CSDN通过智能技术生成

欢迎关注”生信修炼手册”!

Broad GDAC对TCGA的结果进行了整理和深入分析,相关的原始数据和分析结果可以通过网页的方式进行查看和下载,网址如下

http://gdac.broadinstitute.org/

点击Cases可以查看对应的样本信息,点击Data可以下载对应的结果文件,点击Browse可以通过FireBowse查看分析结果,网址如下

http://firebrowse.org/

以Adrenocortical carcinoma为例,在左侧的下拉框中选择对应的疾病,然后在右侧会看到如下所示的柱状图


每个柱子代表了该疾病不同组学的数据,点击柱子可以下载对应的数据。左侧是详细的分析结果

1. Clinical Analyses

分析内容如下

  1. Aggregate AnalysisFeatures

  2. Correlate Clinical vs CopyNumber Arm

  3. Correlate Clinical vs CopyNumber Focal

  4. Correlate Clinica

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