欢迎关注”生信修炼手册”!
Broad GDAC对TCGA的结果进行了整理和深入分析,相关的原始数据和分析结果可以通过网页的方式进行查看和下载,网址如下
http://gdac.broadinstitute.org/
点击Cases
可以查看对应的样本信息,点击Data
可以下载对应的结果文件,点击Browse
可以通过FireBowse
查看分析结果,网址如下
http://firebrowse.org/
以Adrenocortical carcinoma为例,在左侧的下拉框中选择对应的疾病,然后在右侧会看到如下所示的柱状图
每个柱子代表了该疾病不同组学的数据,点击柱子可以下载对应的数据。左侧是详细的分析结果
1. Clinical Analyses
分析内容如下
Aggregate AnalysisFeatures
Correlate Clinical vs CopyNumber Arm
Correlate Clinical vs CopyNumber Focal
Correlate Clinica