TCPA:肿瘤RPPA蛋白芯片数据中心

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蛋白组学数据的分析是肿瘤病理生理学领域常用的手段之一，在TCGA项目中，广泛使用了反相蛋白芯片reverse-phase protein arrays(RPPA)技术来进行肿瘤蛋白质组的研究。

通过该芯片， 能够有效分析多种标记蛋白在样本中的表达量及其变化趋势，是一种经济高效的肿瘤蛋白质组学研究手段。通过整合来自TCGA和几个独立的肿瘤研究项目的RPPA芯片数据，提供了一个肿瘤蛋白质谱数据中心TCPA, 方便科研工作者查看，分析和可视化蛋白质芯片数据。文章发表在nature methods上，链接如下

https://www.nature.com/articles/nmeth.2650

网站链接如下

http://tcpaportal.org/tcpa/

数据分成了下图所示的两个部分

Patient Cohorts用于查看不同肿瘤样本中的蛋白质芯片数据，Cancer Cell Lines用于查看不同细胞系中的蛋白质芯片数据。这两个模块的结构是类似的，以肿瘤样本中的蛋白芯片数据为例，分成了4大模块

1. summa