肿瘤异质性简介

欢迎关注”生信修炼手册”!

肿瘤异质性tumor heterogeneity,是恶性肿瘤的特征之一,可以使肿瘤在生长速度,侵袭与转义,预后等各方面产生差异。

肿瘤异质性的体现形式多种多样,可以简单划分为以下两类

  1. 肿瘤间异质性,inter-tumor heterogeneity, 不用类型肿瘤的细胞存在基因型和表型差异

  2. 肿瘤内异质性,intra-tumor heterogeneity,同一种肿瘤其细胞也存在基因型和表型差异

示意图如下

对于瘤内异质性,又存在不同治疗阶段的时间异质性, 原发和转移肿瘤间的空间异质性等。除此之外,肿瘤微环境之间,肿瘤细胞和肿瘤循环细胞之间,同一肿瘤组织的不同肿瘤细胞也存在异质性。

深入研究肿瘤异质性,有助于了解肿瘤产生的机制,演化规律,解释治疗过程中耐药性等产生的原因,结合不同肿瘤类型和时期,为患者量身定制个性化的治疗方案,更好的实现精准医疗。

关于肿瘤异质性产生的机制,有以下两种假说

1. clonal evolution model

克隆进化模型, 肿瘤细胞群起源与单个细胞,在增殖的过程由于多次突变分化成了不同的亚克隆细胞群,示意如下

该模型又可以进一步划分为线性进化和分支进化模型, 图示如下

线性进化模型描述的肿瘤细胞向着具有生长优势的克隆进化,相比祖先克隆,顺序克隆包含更多的有力突变;分支进化模型中多个亚克隆具有相同的祖先克隆,不同分支的进化大大增加了肿瘤异质性。

2. cancer stem cell model

肿瘤干细胞模型,肿瘤组织内内可以分为肿瘤干细胞和其他细胞两大类,随着肿瘤干细胞的增殖和分化,形成了肿瘤异质性,其他细胞经过几次分化后最终死亡, 示意图如下

目前有各种检测手段可以用于肿瘤异质性的研究,以NGS测序为主的技术手段由于其通量高,检测周期快等特性占据半壁江山,根据检测对象的不同,细分为循环肿瘤DNA(ctDNA), 循环肿瘤细胞(CTC),血液中游离的DNA(cfDNA), 肿瘤组织DNA,在对应的数据分析中,除了常规的call variants外,预测肿瘤亚克隆结构也是一项核心的分析内容。

·end·

—如果喜欢,快分享给你的朋友们吧—

扫描关注微信号,更多精彩内容等着你!

  • 1
    点赞
  • 5
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
代码下载:完整代码,可直接运行 ;运行版本:2022a或2019b或2014a;若运行有问题,可私信博主; **仿真咨询 1 各类智能优化算法改进及应用** 生产调度、经济调度、装配线调度、充电优化、车间调度、发车优化、水库调度、三维装箱、物流选址、货位优化、公交排班优化、充电桩布局优化、车间布局优化、集装箱船配载优化、水泵组合优化、解医疗资源分配优化、设施布局优化、可视域基站和无人机选址优化 **2 机器学习和深度学习方面** 卷积神经网络(CNN)、LSTM、支持向量机(SVM)、最小二乘支持向量机(LSSVM)、极限学习机(ELM)、核极限学习机(KELM)、BP、RBF、宽度学习、DBN、RF、RBF、DELM、XGBOOST、TCN实现风电预测、光伏预测、电池寿命预测、辐射源识别、交通流预测、负荷预测、股价预测、PM2.5浓度预测、电池健康状态预测、水体光学参数反演、NLOS信号识别、地铁停车精准预测、变压器故障诊断 **3 图像处理方面** 图像识别、图像分割、图像检测、图像隐藏、图像配准、图像拼接、图像融合、图像增强、图像压缩感知 **4 路径规划方面** 旅行商问题(TSP)、车辆路径问题(VRP、MVRP、CVRP、VRPTW等)、无人机三维路径规划、无人机协同、无人机编队、机器人路径规划、栅格地图路径规划、多式联运运输问题、车辆协同无人机路径规划、天线线性阵列分布优化、车间布局优化 **5 无人机应用方面** 无人机路径规划、无人机控制、无人机编队、无人机协同、无人机任务分配 **6 无线传感器定位及布局方面** 传感器部署优化、通信协议优化、路由优化、目标定位优化、Dv-Hop定位优化、Leach协议优化、WSN覆盖优化、组播优化、RSSI定位优化 **7 信号处理方面** 信号识别、信号加密、信号去噪、信号增强、雷达信号处理、信号水印嵌入提取、肌电信号、脑电信号、信号配时优化 **8 电力系统方面** 微电网优化、无功优化、配电网重构、储能配置 **9 元胞自动机方面** 交通流 人群疏散 病毒扩散 晶体生长 **10 雷达方面** 卡尔曼滤波跟踪、航迹关联、航迹融合

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值