肿瘤驱动基因的协同和互斥模式

最新推荐文章于 2024-09-16 11:16:36 发布
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本文探讨了肿瘤驱动基因的两种模式：协同和互斥。互斥基因通常在同一路径上，同时出现可能导致细胞衰老和死亡，抑制肿瘤发展；而协同基因则共同促进肿瘤进展。通过对基因的互斥性分析，如使用费舍尔精确检验，可以揭示肿瘤的致病通路，对肿瘤研究具有重要意义。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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肿瘤的发生可以看做是体细胞变异累计的结果，按照所有的变异都正向驱动肿瘤发展的假设，患者包含的体细胞变异越多，其肿瘤发展会越快，然而从基因组测序的结果来看，驱动突变的基因通常是相互排斥的，也就是说如果两个驱动突变的基因同时发生，肿瘤的发展反而会被抑制 ，只出现一个时，则驱动肿瘤的发展。

与互斥模式相反，驱动基因间也会存在协同模式，两个协同的驱动突变往往同时发生，共同促进肿瘤的发展，

按照协同和互斥的作用模式，将突变分为以下两类

  1. co-occurencing mutations

  2. mutually exclusive mutations

互斥的驱动基因往往共享相同的pathway, 其可能的作用模式如下

oncogene1和oncogene2两个驱动基因同时表达， 过度激活ERK通路， 其靶蛋白的过量表达，诱导细胞的衰老和死亡，从而抑制肿瘤发展进程。

驱动基因的互斥可以反映在oncoplot图上，示意如下

不同类型的肿瘤并不会共享某种驱动基因，驱动基因的突变往往只在某种特定肿瘤或者其亚型中表达。在进行互斥性分析时，最经典的分析方法是费舍尔精确检验，示意如下

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