肿瘤基因组图谱 (The Cancer Genome Atlas,TCGA) 计划是由美国国家癌症研究院(National Cancer Institute,NCI)和美国国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute,NHGRI)于2006年联合启动的项目,目前共计研究33种癌症类型。
TCGA利用大规模测序为主的基因组分析技术,从基因组、表观遗传组、转录组、蛋白质组等多个层析解析癌症的分子机制。最终完成一套完整的与所有癌症基因组改变相关的图谱以提高人们对癌症发病分子基础的科学认识及提高我们诊断、治疗和预防癌症的能力。作为目前最大的癌症基因信息的数据库,TCGA蕴藏着难以想象的宝贵信息。
通过整合分析TCGA数据库中33种癌症的基因组、表观遗传组、转录组和蛋白质组等多组学数据,生物和医学研究与应用的利器AIPuFu平台(www.aipufu.com)为广大用户开发了各种相应的免费应用,能帮助用户深度挖掘多种癌症的多组学数据,探究肿瘤发生发展的分子机制(更多精彩请关注微信公众号:AIPuFuBio)。
目前,AIPuFu平台提供的TCGA数据挖掘应用有:
1、《查询各类肿瘤不同性别、年龄、种族、临床分期的生存曲线(TCGA数据)》
地址:http://www.aipufu.com/goods-507.html
2、《查询各种癌症与对照中基因的甲基化差异情况(TCGA数据)》
地址:http://www.aipufu.com/goods-504.html
3、《查询各种癌症与对照中基因的差异表达情况(TCGA数据)》
地址:http://www.aipufu.com/goods-503.html
4、《查询各类肿瘤中两个蛋白的表达水平相关性(CPTAC或TCGA数据)》
地址: