circos 可视化手册- heatmap 篇

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heatmap将一系列的数值映射到一个颜色梯度中,是最常用的图表之一。在circos中,通过plot这个block进行设置。用法如下:
在这里插入图片描述
heatmap的数据和scatter plot, histogram是一样的,最少有4列内容。前3列定义染色体上的区域,第4列指定每个区域的value值,其他列可以是配置文件中的属性,示例如下
在这里插入图片描述
heatmap中的color属性比较特殊,在热图中,需要的是一个颜色梯度,将不同的value映射到这个颜色梯度中。所以这里的color对应的是一个list, 有两种设置方式

1. 采用内置的list

etc目录下,有很多内置的颜色配置,其中就有很多内置的颜色梯度, 示例如下

etc/colors,brewer.conf

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