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heatmap
将一系列的数值映射到一个颜色梯度中,是最常用的图表之一。在circos
中,通过plot
这个block进行设置。用法如下:
heatmap
的数据和scatter plot
, histogram
是一样的,最少有4列内容。前3列定义染色体上的区域,第4列指定每个区域的value
值,其他列可以是配置文件中的属性,示例如下
heatmap
中的color
属性比较特殊,在热图中,需要的是一个颜色梯度,将不同的value
映射到这个颜色梯度中。所以这里的color
对应的是一个list
, 有两种设置方式
1. 采用内置的list
在etc
目录下,有很多内置的颜色配置,其中就有很多内置的颜色梯度, 示例如下
etc/colors,brewer.conf