生信技能--数据的导入导出

1、读文件

1）读excel文件（非压缩文件）

 
header = T      #文件表头作为table表头

sep="\t"        #分隔符设置 ，也可以为其他分隔符，根据您的本地文件进行变更

skipNul = T     #忽略null的格

# 读文件，目录选择您本地的文件
read.table('Desktop/工作/2-生物信息学/R语言/2-文件导入导出/practice-20220117',skipNul = T)   

# 读文件，并将文件内容放入a中（a只是个名称，建议按照场景进行准确命名，方便后续使用）
a=read.table('Desktop/工作/2-生物信息学/R语言/2-文件导入导出/practice-20220117',skipNul = T,header = T)

# 查看a的内容（一般用来检验是否符合上传预期）
View(a)

2）读excel文件（压缩文件）

comment.char = '!'    #指定注释符

待补充

2、写文件

1）写文件（非压缩文件）

# 写成一个csv文件

write.csv(a,'write_practice20220117.csv')  # 未指定目录，则为默认目录

write.csv(a,'Desktop/工作/2-生物信息学/R语言/2-文件导入导出/write_practice20220117_2.csv')  # 指定目录

# 去掉行名

b=read.csv('Desktop/工作/2-生物信息学/R语言/2-文件导入导出/write_practice20220117_2.csv')   # 将读取的csv文件放入b中（b只是个名称，建议按照场景进行准确命名，方便后续使用）

View(b)           #查看b的内容

rownames(b)=b[,1] #定义行名

b=b[,1]           #取第一列

b=b[,-1]          #去掉第一列

3、练习

1）读入文件，看看什么样的文件可以读什么样的文件不可以读；
2）输出文件时把行名去掉；

----------练习没做不要看下面哦-----------
----------练习没做不要看下面哦-----------
----------练习没做不要看下面哦-----------
----------练习没做不要看下面哦-----------

Answer：
1）读入文件，看看什么样的文件可以读什么样的文件不可以读；
可以读：csv、excel、sav、por、dat、sas7bdat；

2）输出文件时把行名去掉；

write.csv(a,'write_practice20220117.csv',row.names = F)
write.table(a,'write_practice20220117.csv',sep=',')     # 输出文件时其他的参数也可同时设置，用逗号分隔不同的参数即可