数据下载
课题设计神经纤维分析,了解到这个网站可以下载一些神经元数据。
数据使用
从上面网站下载到了swc格式的神经元重建数据,但对数据使用不了解,且能查到的资料较少。现在终于找到了SWC格式数据可视化方法,记录下来,以免小菜鸡转头就忘记了。
本人简要总结:
- 从上边下载压缩文件到本地,然后解压
- 在命令行中进入解压后文件位置,如下,
- 在命令行继续输入下图红线内容,就可以如图所示输出了
这条语句中 examples\dCH-cobalt.CNG.swc是我们刚才下载到的压缩包中自带的例子,这启发我,如果想查看其他神经元,只要使用run.bat XXX.swc即可。 - 上述命令行之后会产生神经元窗口了。
如果不行,请仔细查看本文给出的第二个链接。这里给出的简要步骤适合我的电脑现在的情况,也许不普适。
后续
下一步如何使用和分析这些数据还要继续摸索,也许上述记录也存在问题,之后有进展再修正或更新吧。