WDL附带了一个名为wdltool的实用工具包 ，其中包含语法验证功能。
为了验证我们的wdl语法，我们只需调用validate函数在我们的脚本上：
$ java -jar wdltool.jar validate myWorkflow.wdl
此函数解析WDL脚本并提醒我们注意任何语法错误，例如缺少大括号、未定义变量、缺少逗号等等。它将解析导入，但请注意，它无法识别错误，例如命令的键入、指定错误的文件名或未能为在工作流中运行的程序提供所需的输入。
示例：如果调用引用不存在的任务，则出错：
$ java -jar wdltool.jar validate myWorkflow.wdl
ERROR: Call references a task (BADps) that doesn't exist (line 22, col 8)
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