TSGene:肿瘤抑癌基因数据库

TSGene是一个收集并整理抑癌基因信息的数据库,专注研究1217个人类TSGs,涵盖基因表达、变异、调控等方面。通过其丰富的注释数据,提供基因详细信息,包括文献、表达量、调控网络和变异情况,对肿瘤研究具有重要参考价值。

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抑癌基因tumor suppressor gene,简称TSG,是一类存在于正常细胞内,可以抑制细胞生长并且具有潜在抑癌作用的基因。TSGene是一个从文献中收集整理的抑癌基因数据库,文章发表在Nucleic Acids Research,链接如下

https://academic.oup.com/nar/article/41/D1/D970/1074154

数据库的网址如下

https://bioinfo.uth.edu/TSGene/

最新版本为v2.0版本,共收录了1217个human TSGs, 其中包含1018个蛋白编码基因和199个lncRNA,同时对这些基因进行了多种注释,包括表达量,突变位点,蛋白相互作用等注释信息。通过官网的Query菜单,可以检索基因的详细信息,以BRCA1为例,结果如下

1. General information

包含了基因名称,染色体位置,对应的pathway与疾病,序列等信息,示意如下

2. Literature

展示了该基因相关的文献和摘要信息,示意如下

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