2021-01-10

名词解释

1D：ONT平台仅测一个DNA分子的一条链，测序通量比2D高但准确率低于2D序列。

2D：bi-directional reads即ONT平台测DNA分子的正负两链并互相矫正合并的测序数据。

OLC：Overlap-Layout-Consensus算法，先查找全部序列的重叠区域（overlap），基于重叠区域可以获得全部序列的布局图（layout），最终依此预测一致性序列（consensus），该算法为一/三代测序（长序列）的主流算法。

DBG：De-Bruijn graph算法，先将序列打断为更短的k-mer，然后再进行构图，该算法为二代测序（短序列）的主流算法。

Na50：将组装结果从组装错误点打断再进行N50统计的结果。