如何将高通量测序原始数据上传到NCBI的SRA(The Sequence Read Archive)数据库?

数据上传NCBI步骤:
第一步:
登录/注册NCBI:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/.
第二步:
进入NCBI数据上传主页:https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/,如图:
在这里插入图片描述
####################################################
第三步:(重点,我花费了一天的时间)

① 点击 BioProject:填写项目信息
在这里插入图片描述
② BioSample :填写样本属性,例如:年龄、性别、采样时间。。。

③ Sequence Read Archive:填写样本信息表(主要是样本怎么测序的、需要每一个样本的名称)、上传样本数据(需要安装免费的Filezilla或Aspera软件)
在这里插入图片描述
ok,完成

详见:高通量测序数据上传指南 - 搜狐网
https://m.sohu.com/a/361446058_464200?trans=010004_pcwzy.

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细菌16S rRNA基因测序数据的上传至NCBI SRA数据库是非常重要的。SRASequence Read Archive)是一个公共数据库,它存储了各种生物的DNA和RNA测序数据,包括细菌。下面我将解释为什么要将细菌16S rRNA基因测序数据上传至NCBI SRA数据库。 首先,通过将16S rRNA基因测序数据上传至NCBI SRA数据库,可以实现数据的共享和开放。科研人员可以从中共享和获取数据,提高科学研究的效率和可信度。这种共享可以促进各种细菌基因组学研究的进展,并促使更多的研究人员参与进来。 其次,通过上传数据至NCBI SRA数据库,可以提高数据的可靠性和复现性。对科研成果的复现是科学研究的基石,它可以验证实验结果的准确性和可信度。当同一份数据被共享并上传至NCBI SRA数据库时,其他研究人员可以验证和重复原来的研究,从而增加了数据的可靠性。 此外,将细菌16S rRNA基因测序数据上传至NCBI SRA数据库,也有利于相关研究的引用和参考。其他研究人员可以引用和参考已上传的数据,从而推动整个领域的研究进程,提高科学研究的质量和影响力。 综上所述,细菌16S rRNA基因测序数据应上传至NCBI SRA数据库是为了实现数据的共享、提高数据的可靠性和复现性,以及促进相关研究的引用和参考。这将对于细菌基因组学研究的发展和推动具有积极的意义。
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