题目:Silencing of StRIK in potato suggests a role in periderm related to RNA processing and stress
刊名:BMC Plant Biology
作者:Mercè Figueras
单位:Universitat de Girona
小编寄语:很简单的思路,可能因为目的基因的功能不够强,导致文章水平不高。
摘要
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周皮是对陆地植物生存至关重要的保护屏障,但对其发育和调控的遗传因素知之甚少。在软木橡树 (Q. suber ) 周皮中使用转录组学方法,鉴定了一个未知功能的RS2互作的KH蛋白(RIK)同源物。为了深入了解 RIK在周皮中的功能,以马铃薯(S. tuberosum) 块茎周皮为材料:分析出RIK的全长编码序列,以下简称StRIK,对马铃薯沉默植株进行转录组测序,以分析沉默对周皮转录组的影响。StRIK转录本在所研究的所有营养组织中积累,包括周皮和组织(如根)。通过RNA干扰(StRIK-RNAi)下调马铃薯中的StRIK,该实验对块茎周皮解剖特征没有明显影响。但与野生型不同,转基因植物开花,而野生型不开花。StRIK-RNAi 周皮的全球转录谱分析确实显示了与 RNA 代谢、压力和信号传导相关的基因表达的改变。StRIK转录本、花相关表型和StRIK -RNAi周皮的差异基因表明,StRIK在多种植物发育过程中起调节作用。转录组分析表明StRIK可能在外皮的RNA成熟和应激反应中发挥作用。
技术路线