植物突变体库(三)——大白菜突变体库

本文介绍了构建的大白菜EMS突变体库,包含约8000个M2突变体,对促进大白菜功能基因组研究具有重要意义。通过全基因组重测序和突变筛选,鉴定出大量功能突变,建立的CCEMD数据库为研究人员提供了宝贵的资源。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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文章信息

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题目:Construction of a high-density mutant population of Chinese cabbage facilitates the genetic dissection of agronomic traits

作者:Xiaoxue Sun,WeiMa,ShuxingShen,FengCheng,JianjunZhao等

单位:Hebei Agricultural University and Chinese Academy of Agricultural Sciences

期刊:Molecular Plant

日期:Available online 9 February 2022

摘要

2

大白菜( Brassica rapa ssp. pekinensis ) 是具有重要经济意义的蔬菜。为了促进大白菜的功能基因组研究,作者使用双单倍体自交系A03作为亲本,产生了约8000个M2的甲磺酸乙酯(EMS)突变体群体。A03的基因组被测序并用作全基因组水平基因突变的高通量功能的参考。共 300个M2至M5的EMS突变体经过表型筛选,然后测序,得到了750629个 SNP 和46272个InDel突变,覆盖了A03基因组中所有预测基因的98.27%。此外,作者还建立了大白菜EMS突变数据库(CCEMD,www.bioinformaticslab.cn /EMSmutation/home) 以增加这种突变种群资源的可用

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