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文章信息
题目:Single-cell RNA-seq describes the transcriptome landscape and identifies critical transcription factors in the leaf blade of the allotetraploid peanut (Arachis hypogaea L.)
刊名:Plant Biotechnology Journal
日期: 26 June 2021
作者:Hao Liu, Yanbin Hong et al.
单位:广东省农业科学院作物研究所
摘要
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单细胞 RNA-seq (scRNA-seq) 已成为描述人类细胞转录组的常用工具,但该技术尚未广泛应用于植物细胞。这里,研究者描述了一个在花生叶中成功开发的原生质体细胞分离系统。基于标记基因,应用 scRNA-seq 将总共 6,815 个单细胞分成 8 个细胞簇。使用伪时间分析来描述叶片生长过程中不同细胞类型的转录因子(TF)的发育轨迹和相互作用网络。该轨迹使重新研究叶肉和表皮的原基驱动的发育过程成为可能