spm FMRI 各种小问题合集

预处理

1、预处理结果从normalize之后开始头歪、变形

问题描述：如下图

原因：DICOM2NIfTI时必须检查对应的T1像。下面是两种错误形式，第一种容易发现，第二种容易忽视，大脑失状位左右颠倒。


解决：重新转了一回格式，建议用SPM fmri进行格式转换。之前是用MRIconvert转换的，用了两台电脑，有的T1结果是对的，不确定什么原因产生的错位，操作都是一样的。

2、Check reg大脑图片边缘出边框

问题描述：

原因：应该是图片排版导致的，单独check就会发现大脑是全的。
解决：少选几张图片。

3、用代码进行预处理时matlabbatch{1}.spm.temporal.st.scans 的一个小细节

自己写代码读取图像的时候注意
save script时，变量以一张图像为例

matlabbatch{1}.spm.temporal.st.scans  = {
‘G:\analysis_format\Sub_021\54697_003_fMRI_task_run1_20210415\003_285.img,1'}

% 但是自己写读入的时候dir file格式一般为
{‘G:\analysis_format\Sub_021\54697_003_fMRI_task_run1_20210415\003_285.img'}
%划重点！！并没有最后的‘,1’

%不确定这个的作用，但是最好保持一致，增加该字符串的语句如下
a = 'G:\analysis_format\Sub_021\54697_003_fMRI_task_run1_20210415\003_285.img'
b = ',1'
c ={ [a,b]}