系统进化建树
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中国医学科学院&北京协和医学院研究生一枚,生物信息学+合成生物学欢迎交流。如切如嗟,如琢如磨!
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惕佫酰假托品合酶的发现-文献精读28
茄科植物通过3α-和3β-托品醇的酯化生成托品烷生物碱(TAs)。尽管已知Littorine合酶负责3α-托品醇的酯化,进而导致莨菪碱的生物合成,但与3β-托品醇酯化相关的基因尚不清楚。在此,我们报告了来自颠茄的一个BAHD酰基转移酶,惕佫酰假托品合酶(TS),催化3β-托品醇和巴豆酰辅酶A(tigloyl-CoA)形成惕佫酰假托品,这是打碗花精生物合成的关键中间体,也是治疗神经退行性疾病的潜在药物。与其他定位于细胞质的BAHD酰基转移酶不同,TS定位于线粒体。通过分子对接和定点突变揭示了TS的催化机制。原创 2024-07-06 15:44:11 · 933 阅读 · 0 评论 -
五种肉苁蓉属植物叶绿体基因组-文献精读25
肉苁蓉属是列当科的重要属类,具有重要的药用、经济和防治荒漠化的价值。然而,肉苁蓉属的系统发育关系尚不清晰。迄今为止,还没有有效的分子标记能够有效区分报道的肉苁蓉属近缘种类。在本研究中,我们获得并表征了来自中国的四种肉苁蓉属植物的叶绿体基因组,以澄清该属内的系统发育关系,并开发用于物种鉴定的分子标记。原创 2024-07-01 15:39:20 · 1068 阅读 · 0 评论 -
RAxML-NG安装与使用-raxml-ng-v1.2.0(bioinfomatics tools-013)
在这里,我们介绍我们的新代码RAxML-NG(RAxML下一代)。它结合了RAxML和ExaML的优势和概念,并提供了我们在下一节中将描述的几项额外改进。所以,ML建树的最新一代版本软件,横空出世,一代版本一代神,代代版本ML树!原创 2024-03-16 23:24:42 · 2199 阅读 · 1 评论