分子AI预测赛-Task01

AI-夏令营-机器学习挑战赛

#AI夏令营 #Datawhale #夏令营

感谢DW团队

预备阶段：baseline初体验 2024.06.29-2024.06.30

学习内容【十分钟轻松了解学习内容跑通baseline】

赛事平台

赛事平台链接

小白零基础 5 分钟速通指南

step1:报名赛事

step2:五分钟体验baseline

• 登录百度账号

• 一键运行
  

• 启动环境

• 运行全部cell

• 获得成绩

---

其他内容

什么是PROTACs

PROTACs（Proteolysis-Targeting Chimeras）是一类新兴的药物设计工具，用于靶向和降解特定的蛋白质。PROTACs通过诱导细胞内的蛋白质降解机制，选择性地降解致病蛋白质，从而实现治疗效果。

PROTACs的结构与工作机制
结构：

两部分：PROTAC分子由两个部分组成，分别是靶向配体（targeting ligand）和E3连接酶配体（E3 ligase ligand），它们通过一个连接子（linker）连接在一起。
靶向配体：与目标蛋白质结合。
E3连接酶配体：与细胞内的E3连接酶结合。
连接子：连接靶向配体和E3连接酶配体，长度和性质根据需要设计。
工作机制：

结合目标蛋白质：PROTAC分子中的靶向配体与目标蛋白质结合。
招募E3连接酶：E3连接酶配体与细胞内的E3连接酶结合，形成一个三元复合物（PROTAC-目标蛋白质-E3连接酶）。
泛素化：E3连接酶将泛素分子附加到目标蛋白质上，标记其进行降解。
蛋白质降解：泛素化的目标蛋白质被细胞内的蛋白酶体识别并降解。
PROTACs的优势
高选择性：PROTACs能够高度选择性地降解特定的蛋白质，降低了副作用的风险。
降解功能：与传统的小分子抑制剂不同，PROTACs不只是抑制目标蛋白质的功能，而是完全降解目标蛋白质，从而避免其潜在的恢复活性。
低剂量：由于PROTACs通过催化机制作用，可以在较低剂量下实现有效的蛋白质降解。
处理耐药性：PROTACs可以降解传统小分子药物无法处理的耐药蛋白质变体。
PROTACs的应用
PROTACs在许多领域具有广泛的潜力，包括：

癌症治疗：通过降解致癌蛋白质来治疗各种癌症。
神经退行性疾病：降解积累的有害蛋白质，以治疗如阿尔茨海默病和帕金森病等疾病。
感染性疾病：靶向和降解病原体蛋白质，治疗感染。
PROTACs代表了一种创新的药物设计理念，具有巨大的临床应用潜力。目前，许多制药公司和研究机构正在积极探索和开发基于PROTACs的药物。（内容搬运自ChatGPT）

什么是baseline

机器学习和人工智能：
定义：在进行模型训练和评估时，用于比较的简单模型或初步结果。
用途：评估新模型或方法的性能提升。通常是指使用简单算法（如线性回归、随机森林）或已知方法获得的基准结果。
示例：在图像分类任务中，使用简单的K近邻算法的准确率作为基线，以评估更复杂的深度学习模型的改进。（内容节选自ChatGPT回答）

---

感受

前后5min，很快就运行完了，并没有太大的收获，只是对于机器学习有了一个直观的感受。

这个夏令营不简单 #AI夏令营 #Datawhale #夏令营

文章内容来源于DW文档以及网站截图，系个人记录使用，侵删