R语言与临床模型预测——LASSO回归,单因素多因素cox,差异表达分析,Venn图,森林图,列线图,矫正曲线,ROC全套代码及解析——第十一部分 多因素cox回归建模 本专栏可免费答疑

本文介绍了使用R语言进行临床数据的预处理、多因素Cox回归建模以及相关图表绘制,包括差异表达基因筛选、LASSO回归、森林图、列线图和ROC曲线分析。通过多因素Cox回归,确定独立的预后因素并构建风险评分公式。
摘要由CSDN通过智能技术生成

1.下载数据

2. 匹配基因

3. 基因去重复

4.匹配临床数据

5.批量cox回归分析

6.差异表达基因筛选

7.取交集,选出预后相关的差异表达基因

8.森林图绘制

9.lasso回归进一步排除具有共线性的基因

10.验证集验证,数据合并验证

11.多因素cox回归建模

12.列线图

13.矫正曲线

14.ROC曲线分析

上次我们用41个自噬相关基因构建了一个风险评分公式,公式为:0.38353284*data$LAMP1-0.09076670*data$BNIP3+0.17786484*data$EIF4EBP1-
  0.03640619*data$FOXO1-0.36590890*data$PINK1-0.05398547*data$ITPR1-0.13377712*data$CHMP2B-
  0.25142852*data$ZFYVE1-0.12728886*data$PARK2-0.30799367*data$CX3CL1

下面我们要讲多因素cox回归建模,首先准备一下数据:

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