1.下载数据
2. 匹配基因
3. 基因去重复
4.匹配临床数据
5.批量cox回归分析
6.差异表达基因筛选
7.取交集,选出预后相关的差异表达基因
8.森林图绘制
9.lasso回归进一步排除具有共线性的基因
10.验证集验证,数据合并验证
11.多因素cox回归建模
12.列线图
13.矫正曲线
14.ROC曲线分析
上次我们用41个自噬相关基因构建了一个风险评分公式,公式为:0.38353284*data$LAMP1-0.09076670*data$BNIP3+0.17786484*data$EIF4EBP1-
0.03640619*data$FOXO1-0.36590890*data$PINK1-0.05398547*data$ITPR1-0.13377712*data$CHMP2B-
0.25142852*data$ZFYVE1-0.12728886*data$PARK2-0.30799367*data$CX3CL1
下面我们要讲多因素cox回归建模,首先准备一下数据: