R语言与临床模型预测——LASSO回归,单因素多因素cox,差异表达分析,Venn图,森林图,列线图,矫正曲线,ROC全套代码及解析——第五部分 批量cox回归分析 本专栏可免费答疑

上次我们将自噬相关基因的表达数据与临床数据进行了匹配,下面我们进行批量cox回归分析,筛选出预后相关的自噬基因:

这个临床模型预测会针对一个案例进行讲解,目录如下:

1.下载数据

2. 匹配基因

3. 基因去重复

4.匹配临床数据

5.批量cox回归分析

6.差异表达基因筛选

7.取交集,选出预后相关的差异表达基因

8.森林图绘制

9.lasso回归进一步排除具有共线性的基因

10.验证集验证,数据合并验证

11.多因素cox回归建模

12.列线图

13.矫正曲线

14.ROC曲线分析

下面我们先看看上一期生成的文件:

 这是已经匹配好临床数据和基因表达的文件,下面我们进行cox回归分析,首先读取并查看数据:


                
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