上次我们将自噬相关基因的表达数据与临床数据进行了匹配,下面我们进行批量cox回归分析,筛选出预后相关的自噬基因:
这个临床模型预测会针对一个案例进行讲解,目录如下:
1.下载数据
2. 匹配基因
3. 基因去重复
4.匹配临床数据
5.批量cox回归分析
6.差异表达基因筛选
7.取交集,选出预后相关的差异表达基因
8.森林图绘制
9.lasso回归进一步排除具有共线性的基因
10.验证集验证,数据合并验证
11.多因素cox回归建模
12.列线图
13.矫正曲线
14.ROC曲线分析
下面我们先看看上一期生成的文件:
这是已经匹配好临床数据和基因表达的文件,下面我们进行cox回归分析,首先读取并查看数据: