TBtools的序列提取步骤

最新推荐文章于 2024-12-16 18:33:36 发布
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版权

一、安装

TBtools GitHub 页面：GitHub - CJ-Chen/TBtools-II: GUI/CommandLine Tool Box for biologistists to utilize NGS data.TBtools GitHub 页面： https ://github .com /CJ -Chen /TBtools

在 GitHub 页面上，你可以找到最新版本的下载文件，通常是 .tar.gz 或 .zip 格式。点击 "Releases" 选项卡查看并下载适合你操作系统的版本。

二、提取序列

按照红色圈点击

出现以下页面

以序列8395为例，如下图

① 将序列8395.fasta序列导入第一个红框里&#

最低0.47元/天 解锁文章
TBtools | 多图合一至强版教程！进化树 + Motifs + 结构域 + 启动子 + 基因结构 + ....
abai0410的博客
04-05 2万+
放一张效果图，这些，三四年前的东西，我其实一直懒得说。 写在前面 “Gene Structure View (Advanced)”这个功能可以说，也是一时兴起写出来的。开发的主要动机，还是发现师弟师妹在做的事情实在是太费时间精力。就这样，四五年过去了。直到现在，我仍然没搞懂，这个功能是怎么被大伙用起来的。我甚至没有花过时间，专门为这个功能写教程。网络上已有的教程，均是用户们自发总结，确实已经讲解得足够清晰明白。多少，我有时看到还是有点感动，毕竟这些事情也可以说是软件开发的一部分。太懒，仍然是我的问题。工.
顺式作用元件包括_植物启动子顺式作用元件批量提取预测可视化分析
weixin_42376799的博客
01-02 6320
!!!!，注意上图是**顺式作用元件在启动子上的批量可视化，当然最后坐标要自己调，直接全部-2000bp，5' 和 3‘ 替换 **写在前面以前总看到问题是，基因结构可视化的问题；现在则变成了启动子元件的预测或者说可视化。这本身比较简单，也比较玄乎，所以我一直不是太乐意与别人讨论。但学院今天断网，手上的工作无法正常开展。正好有旧友也问起，那么我就写写。其实，有了TBtools，这些分析，...
TBtools_windows-x64_0_66673.rar
05-10
TBtools最新版本程序，由《生信札记》微信公众号官方发布。 主要功能：序列提取，基因功能分析，本地Blast界面化，热图，韦恩图，Upset图 基因结构可视化，共线性分析与可视化 Circos图绘制，dnds批量计算等等...
生信分析-利用TBtools提取序列
qq_44520665的博客
10-24 1万+
准备文件 gtf/gff3 全基因组fasta 背景知识 CDS=coding sequence,是编码区，是可翻译成蛋白质的exon的集合 cDNA比CDS多了5’-UTR和3’-UTR区域，是所有exon的集合 gene就是所有exon+intron的集合啦 提取CDS 提取genome 提取cDNA 就是提取所有的exon啦 ...
TBtools安装教程以及序列提取步骤
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TBtools使用教程 一、 TBtools软件安装 下载地址： https://github.com/CJ-Chen/TBtools-Manual 点击安装包正常安装就可以 二、 TBtools提取DNA序列 打开TBtools，按照下图依次点击： 来到下图所示界面： 图一↑ 下面以从中牧一号cds序列提取已知基因号为例： ① 将中牧一号的cds序列拖到图一红框里，然后点击右边红字initialize 等待出现上图红框，点击确定 ② 选择一个文件夹作为输出文件夹，可直接将文件夹拖到图一黄框里，如下图
使用TBtools将CDS序列转换成蛋白文件
m0_48091821的博客
12-16 1101
仅自用并记录过程，如有问题请联系。
TBtools-生物信息分析
07-02
该软件主要用于生物信息相关分析。主要功能包括序列批量提取、转存、转录组富集分析
TBTOOLS的使用：用TBTOOLS实现多序列比对
wuyuankang的博客
07-20 2万+
打开TBTOOLS，点击Blast，按照图示，选择TWO Sequence Files 输出格式选择Table，更方便获取序列ID 点击Start，开始运行！ 得到图示结果！
有参转录组实战7-基因序列提取
liangjinghui123的博客
01-24 1755
传统的提取序列方式，有学习门槛，用TBtools也行。
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11-20
如果你想要从TBTools中提取蛋白质序列集合，通常涉及到TB数据的挖掘和预处理步骤。以下是使用TBTools提取蛋白质序列的一般过程： 1. 安装TBTools：首先需要安装TBTools，可以使用pip命令，如 `pip install tbtools`...
TBtools_windows-x64_1_049.rar
08-05
2020年08月05 - TBtools 最新版本 - 既然到处有人上传我写的工具赚积分，那我就直接自己也上传一个。
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06-28
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- *1* [TBtools安装教程以及序列提取步骤](https://blog.csdn.net/Elean_Fang/article/details/121795875)[target="_blank" data-report-click={"spm":"1018.2226.3001.9630","extra":{"utm_source":"vip_chatgpt_...
TBtools V1.098：生物信息学领域的新星
序列工具包是TBtools核心功能之一，它包括对序列的基本编辑、提取、拼接、翻译等功能。用户可以通过这个模块对DNA、RNA和蛋白质序列进行剪辑，快速得到所需的序列片段。此外，还能够对序列进行质量控制和格式转换，...
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weixin_62735625的博客
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首先，需要准备两个文件。第一个是建库（近缘物种目标基因），类似于这种格式；第二个是自己物种的protein.fasta 打开TBtools，选择blast→several sequences to a big file 然后，在方框处，上载自己的建库文件，然后在下面选择自己物种的protein文件，然后填入自己结果的输出路径以及文件命名，开始start 然后得到了结果文件 Query id：查询序列ID标识 Subject id：比对上的目标序列ID标识 % iden
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探秘TBtools-II：生物学家的强大数据处理工具箱 去发现同类优质开源项目:https://gitcode.com/ 随着高通量测序技术的飞速发展，生物学进入了大数据时代。然而，海量的数据分析常需依赖编程和命令行环境，这对于许多专注于实验的湿实验室生物学家来说是个挑战。这就是TBtools-II大展身手的地方了，它是一个集成多种生物信息学工具的独立软件，带有直观易用的界面，能大大简化生物数据分...
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