本地blast~TBtools

首先，需要准备两个文件。第一个是建库（近缘物种目标基因），类似于这种格式；第二个是自己物种的protein.fasta

打开TBtools，选择blast→several sequences to a big file

然后，在方框处，上载自己的自己物种的protein文件，然后在下面选择建库文件，然后填入自己结果的输出路径以及文件命名，开始start

然后得到了结果文件

Query id：查询序列ID标识

Subject id：比对上的目标序列ID标识

% identity：序列比对的一致性百分比

alignment length：符合比对的比对区域的长度

mismatches：比对区域的错配数

gap openings：比对区域的gap数目

q. start：比对区域在查询序列(Query id)上的起始位点

q. end：比对区域在查询序列(Query id)上的终止位点

s. start：比对区域在目标序列(Subject id)上的起始位点

s. end：比对区域在目标序列(Subject id)上的终止位点

e-value：比对结果的期望值

bit score：比对结果的bit score值