线性代数-皮尔逊相关系数

单于夜遁逃

已于 2022-06-08 13:12:27 修改

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分类专栏：线性代数

于 2022-06-08 13:10:54 首次发布

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	$n_{1}$	$n_{2}$	$n_{3}$	$n_{n}$	均值
$m_{1}$	$x_{1}$	$x_{2}$	$x_{3}$	$x_{n}$	$\bar{x}$
$m_{2}$	$y_{1}$	$y_{2}$	$y_{3}$	$y_{n}$	$\bar{y}$
$m_{3}$
...
$m_{m}$

以单细胞数据为例，假设有m个基因和n个细胞，即为一个 $m\times n$ 的矩阵

设 $m_{1}n_{1}=x_{1}$ ， $m_{2}n_{1}=y_{1}$ ，以此类推

则相关系数r可以表示为： $r=\frac{\sum (x_{i}-\bar{x})(y_{i}-\bar{y})}{\sqrt{\sum (x_{i}-\bar{x})^{2}}\sqrt{\sum (y_{i}-\bar{y})^{2}}}$

由于样本标准差： $\sigma _{x}=\sqrt{\frac{\sum (x_{1}-\bar{x})^{2}}{n-1}}$ ， $\sigma _{y}=\sqrt{\frac{\sum (y_{1}-\bar{y})^{2}}{n-1}}$

综合两式， $m_{1}$ 基因和 $m_{2}$ 基因的相关系数可以表示为： $r=\frac{1}{n-1}\sum (\frac{x_{i}-\bar{x}}{\sigma _{x}})\sum (\frac{y_{i}-\bar{y}}{\sigma _{y}})$

以此类推，得到一个 $m\times m$ 的矩阵（对称矩阵）：

$\begin{bmatrix} 1 & r & & & \\ r& 1 & & & \\ & & 1 & & \\ & & & 1 & \\ & & & & 1 \end{bmatrix}$

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