[stain norm] 病理图片染色处理笔记

失败的stain norm

因为要涉及多张病理图片的stain norm,所以需要一对一地进行transforms,但是即使这么做了,使用 vahadane 还是出现了奇怪的染色情况。

reference_images:
在这里插入图片描述
source_images:
在这里插入图片描述
结果变成了这种玩意:
在这里插入图片描述
原因分析:
reference_image的大小是(2000, 2500)
但是sources_image的大小为(512,512)
可能会导致一些问题

成功的vahadane示例

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在这里插入图片描述
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在这里插入图片描述
输出的图片:
在这里插入图片描述
颜色确实变深了一点。

vahadane控制变量和后面对比

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在这里插入图片描述
最后变成:
在这里插入图片描述
颜色变淡了一些。

macenko效果没有vahadane好

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最后出来的结果:
在这里插入图片描述

torchvahadane能够使用gpu加快运算速度

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在这里插入图片描述
reference_images:
![在这里插入图片描述](https://i-blog.csdnimg.cn/direct/b8170b71aa3842de82b95c72993bbce4.png

cuda_results:
在这里插入图片描述
cpu_results:
在这里插入图片描述
可以看到vahadane在有一些图片上效果也是一般般。
可能最主要的原因还是染色的色域差得有点大吧。

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