空间转录组基础分析之整合篇

作者，Evil Genius

11月了，又是一年，时间真快

今天这一篇我们来讨论关于空间转录组数据整合的问题，大家在此之前可以先参考一下文章

单细胞基础分析之多样本整合篇

超全总结--单细胞+空间转录组的整合分析方法总结

单细胞多组学整合分析方法讨论

单细胞 & 空间整合去批次方法比较（2）

单细胞 & 空间整合去批次方法比较

关于空间转录组数据的整合问题，一开始认为主要和单细胞数据联合来看细胞的空间位置，现在看来，还是浅，我们来看看空间转录组数据整合分析的内容，这次我们要多参考一篇文章。

2022年8月发表于nature的文章 Spatial multi-omic map of human myocardial infarction对空间组学数据做了整合分析，并且从细胞和分子两个角度进行了整合，这部分整合的内容我详细分享过，文章在时空多样本聚类分析导论，这里就不过多介绍了。

细胞聚类

分子聚类

2022年8月发表于blood的文章Immunothrombosis and vascular heterogeneity in cerebral cavernous malformation仅是看一些关键基因的空间表达，而且大部分文章都是这样。