文本处理三驾马车之 grep

grep 用于查找文件里符合条件的字符串。

grep [-abcEFGhHilLnqrsvVwxy][-A<显示列数>][-B<显示列数>][-C<显示列数>][-d<进行动作>][-e<范本样式>][-f<范本文件>][--help][范本样式][文件或目录...]

grep pattern files	         # 搜索文件中包含pattern的行
grep -v pattern files		 # 搜索文件中不包含pattern的行

grep -f pattern.txt files	 # 搜索的pattern来自于文件中
grep -i pattern files		 # 不区分大小写。默认搜索是区分大小写的
grep -i pattern files		 # 只匹配整个单词，而不是字符串的一部分（如搜索hello，不会匹配到helloworld）
grep -n pattern files		 # 显示行号信息
grep -c pattern files		 # 显示匹配的行数
grep -l pattern files		 # 只显示匹配的文件名
grep -L pattern files		 # 显示不匹配的文件名
grep -C number pattern files     # 额外显示匹配行的上下[number]行
grep pattern1 | grep pattern2 files     # 显示既匹配pattern1，又匹配pattern2的行
grep -E "pattern1|pattern2" files	# 显示匹配pattern1或者pattern2的行, grep -E相当于egrep

# 用于搜索的特殊字符
^: 表示行前
$: 表示行尾

grep '^#' result.vcf		# 显示VCF文件的表头信息
grep '^hello$' files		# 显示只包含hello的行
grep -v '^\s*$' file		# 删除空白行
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