文本处理三驾马车 • grep • sed • awk

正则表达式：是对字符串操作的一种逻辑公式，就是用事先定义好的一些特定字符、及这些特定字符的组合，组成一个“规则字符串”，这个“规则字符串”用来表达对字符串的一种过滤逻辑。
^ 行首
$ 行尾
. 换行符之外的任意单个字符
? 匹配之前项0次或者一次
+ 匹配1次或者多次
* 匹配0次或者多次
{n} 匹配n次
{n,} 匹配至少n次
{m,n} 至少m,最多n
[] 匹配任意一个
[^] 排除字符
| 或者

 

 

 

cat example.gtf|grep "UTR"| head

cat example.gtf|grep -w -e "UTR" -e "exon"

cat example.gtf|grep -w -e "UTR|exon"                                            表达式

cat example.gtf|grep -w "UTR\|exon"                                                  转义

sed：流编辑器，一般用来对文本进行增删改查
用法：sed [-options] 'script' file(s)
常见参数：
-n ：禁止显示所有输入内容，只显示经过sed处理的行(常用)
-e ：直接在命令模式上进行sed 的动作编辑，接要执行的一个或
者多个命令
-i ：直接修改读取的文件内容，不输出。

cat readme.txt


cat -n readme.txt

 

如何删除行

cat >file123 
cat file123 

cat file123 |sed '/^$/d'