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微生物脂肪酸/长链烷烃单体13C丰度
测试服务重磅来袭
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所测何为
脂肪酸-同位素探针技术
(FA-SIP)
揭示微生物主要类群(细菌、真菌、放线菌、菌根真菌等)生物量变化及其与碳循环过程的直接联系!
长链烷烃-同位素探针技术
(LCA-SIP)
反映特定植物类群(水生vs陆生,草本vs木本,碳三vs碳四,等)残体留存变化及其对历史气候环境的响应!
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我们的优势
专业团队
有近20年的微生物脂肪酸分析的技术积累;由古气候相关老师负责长链烷烃样品前处理和数据解析;
专业仪器
测定脂肪酸/长链烷烃的组成和含量与测定其单体的13C丰度使用同一套GC系统,数据可比性强(图1);
图1. 脂肪酸/长链烷烃组成含量及单体13C丰度测定系统
专人负责
由专门技术员负责样品前处理和上机,速度快,数据准确;
贴心服务
随时咨询技术和数据分析问题;正规、便捷的财务服务;灵活多样的测试优惠。
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携手共进
为推进土壤生物生态功能研究,本实验室向国内外同行开放相关技术服务(表1)。同时,自今日起,将在微信公众号“易Science”不定时发布和讨论相关技术资料或心得;也欢迎大家赐稿,共同推进相关技术的发展完善,并寻找潜在的合作契机。扫码关注“易Science”,即享受九折优惠;若分享技术资料或心得,一旦录用,即成为“隐形”合作伙伴,可再享受(在其他优惠措施的基础上)额外的八折优惠。
欢迎咨询:张老师,邮箱:15920305810@139.com。
个人微信和“易Science”公众号的二维码请见页面底部。
表1.本实验室提供的测试服务及方法概述
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FA-SIP技术发展概述
磷脂脂肪酸(PLFA)是活体微生物细胞膜的重要组分(图2),PLFAs图谱与微生物群落组成紧密相关(Willers et al., 2015, J Appl Microbiol.),且与DNA/RNA测序相比,能更灵敏地反映微生物群落结构的变化;自1998年,Nature发表PLFA-SIP相关文章以来(Boschker et al., 1998, Nature),PLFA-SIP技术在揭示微生物对生物地球化学循环的贡献中的相对优势得到重视(Neufeld et al., 2007, ISME J; Watzinger, 2015, SBB),国内学者也陆续开始关注PLFA-SIP技术(Lu et al., Environ Microbiol.; Qiu et al., 2008, ISME J; Yao et al., 2015, Plant Soil; Huang et al., 2020, SBB)。综合运用PLFA-SIP和DNA/RNA-SIP技术(Wilhelm et al., 2019, ISME J),以及氨基糖-SIP技术,已成为研究微生物生态功能的关键前沿技术。此外,中性脂肪酸(NLFA)与真核生物的食性和能量储备有紧密关系,NLFA-SIP也是PLFA分析的很好补充。
图2. 微生物细胞膜上的磷脂脂肪酸(图片来自网络)
重要参考文献
Boschker JT, Nold SC, Wellsbury P, Bos D, de Graaf W, Pel R, et al. (1998). Direct linking of microbial populations to specific biogeochemical processes by 13C-labelling of biomarkers. Nature 392: 801–805. doi:10.1038/33900
Huang J, Liu W, Deng M, Wang X, Wang Z, Yang L, Liu L. (2020). Allocation and turnover of rhizodeposited carbon in different soil microbial groups: A meta-analysis. Soil Biology and Biochemistry, 107973. doi:10.1016/j.soilbio.2020.107973
Lu Y H, Abraham WR, Conrad R. (2007). Spatial variation of active microbiota in the rice rhizosphere revealed by in situ stable isotope probing of phospholipid fatty acids. Environ Microbiol. 9(2): 474-81. doi: 10.1111/j.1462-2920.2006.01164.x.
Neufeld JD, Wagner M, Murrell JC. (2007). Who eats what, where and when? Isotope-labelling experiments are coming of age. ISME J. 1(2):103-10. doi: 10.1038/ismej.2007.30.
Qiu Q, Noll M, Abraham WR, Lu Y, Conrad R. (2008). Applying stable isotope probing of phospholipid fatty acids and rRNA in a Chinese rice field to study activity and composition of the methanotrophic bacterial communities in situ. ISME J. 2(6):602-14. doi: 10.1038/ismej.2008.34.
Watzinger A. (2015). Microbial phospholipid biomarkers and stable isotope methods help reveal soil functions. Soil Biology and Biochemistry, 86, 98–107. doi:10.1016/j.soilbio.2015.03.019
Wilhelm RC, Singh R, Eltis LD, et al. (2019). Bacterial contributions to delignification and lignocellulose degradation in forest soils with metagenomic and quantitative stable isotope probing. ISME J 13, 413–429. https://doi.org/10.1038/s41396-018-0279-6
Willers C, Jansen van Rensburg PJ, Claassens S. (2015). Phospholipid fatty acid profiling of microbial communities--a review of interpretations and recent applications. J Appl Microbiol. 119(5):1207-18. doi: 10.1111/jam.12902.
Yao H Y, Chapman SJ, Thornton B, et al. (2015). 13C PLFAs: a key to open the soil microbial black box? Plant Soil 392, 3-15. https://doi.org/10.1007/s11104-014-2300-9
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