Frontiers | 牧草-微生物域间生态网络与高寒草地生产力相关

中文标题:牧草-微生物域间生态网络与高寒草地生产力相关

英文标题:Grass-microbial inter-domain ecological networks associated with alpine grassland productivity

期刊:Frontiers in Microbiology

发表时间:2023.1

第一作者:王英成,党宁

通讯作者:邓晔,芦光新

作者单位:青海大学,中国科学院生态环境研究中心,中国科学院沈阳应用生态研究所

文章链接:https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1109128

摘要

牧草与土壤微生物之间的相互联系会强烈影响植被群落结构。然而,关于牧草生产力和多样性与土壤微生物之间的关系,以及牧草和微生物的网络互作模式尚不清楚。在本研究中,我们调查了16个高寒草地样点的牧草生产力和多样性,检测了土壤理化性质,并利用高通量测序技术测定了土壤细菌和真菌群落。利用距离衰减关系、域间生态网络和Mantel检验,研究了高寒草地牧草生产力、多样性与微生物多样性之间的关系以及牧草与微生物域间网络模式。我们的研究发现古菌richness,细菌richness和Shannon指数,以及真菌的α多样性与牧草多样性显著负相关,但古菌和细菌α多样性与牧草生产力呈正相关关系。此外,研究发现随着牧草生产力、多样性和土壤变量差异的增加,微生物β多样性增加。方差分解的结果表明牧草生产力对微生物群落的贡献大于土壤变量和牧草多样性,说明牧草生产力与微生物群落的关系更加密切。域间生态网络表明,牧草与部分细菌、古菌和真菌物种形成了复杂而稳定的生态网络,其中,牧草与真菌的生态网络鲁棒性更高,表明高寒草地土壤真菌能与地上牧草植被更好地共存。另外,牧草-微生物网络连通性与牧草生产力显著正相关,说明牧草与微生物网络共存模式对于牧草生产力具有正反馈作用。本研究结果对于建立高寒草地生态系统植物与微生物之间的调节机制具有重要意义。

研究背景

植被生产力作为一个重要的生态属性,与物质循环、能量流动和碳循环密切相关,而地上生物量正是植被群落生产力的重要指标。植被物种丰富度被认为可以稳定生态系统,从而维持可持续的生态系统功能和服务。青藏高原区域物种和生态系统的演化和发展是动态的、多变的,考虑到该区域特殊的地形和高寒气候,植被生物量已被用作反映全球气候变化的指标。尽管土壤水文和生物地球化学过程的改变在植被变化中发挥作用,但微生物群落作为植被-土壤反馈过程中非常重要的生物参与者,并且扮演着重要的生态功能在青藏高原生态系统中。然而,很少有研究去探究该区域中土壤微生物多样性与牧草生产力间的相互关系。

植被与土壤微生物之间的关系对植被的生长具有重要影响。土壤微生物与植被不仅相互提供有益物质,形成互惠共生关系,而且相互竞争环境资源。这些关联和反馈形成了地上和地下生态系统组成部分之间的重要联系。土壤微生物可以改变植被群落动态变化,而植被物种对土壤微生物的不同响应有助于负频率依赖的植物种群动态,这可能会促进植被多样性变化。因此,探究青藏高原高寒草地植被生产力与土壤微生物之间的关系对该区域的整个生态系统至关重要。

研究方法

研究区域位于青海省三江源区域,于2018年8月份在一条横跨2121公里的样带上选定16个样点,其中,高寒湿地草甸(ASM)有2个样点,高寒草甸(AM)和温性草原(TS)有4个样点,高寒草原(AS)有6个样点,针对每个样点做3个重复,最后获取48个样本。在草地调查中,每个样点我们设置50*50 cm样方,调查样方内的植被高度、盖度、物种数、植被生物量,同时利用根钻钻取0-15 cm深的土壤样本用于后续土壤理化性质检测和DNA测序。对于高通量测序结果,我们主要利用距离衰减关系、域间生态网络(http://mem.rcees.ac.cn:8081)和mantel检验,研究了高寒草地牧草生产力、多样性与微生物多样性之间的关系以及牧草与微生物域间网络模式。

主要结果

1.牧草生产力和多样性与微生物α多样性的关系

牧草的生产力和多样性与微生物α多样性之间的相关性表明,古菌richness、细菌richness和Shannon指数以及真菌群落的α多样性均与牧草的多样性呈显著负相关,但古菌Pielou指数与牧草多样性呈显著正相关。古菌richness、Shannon指数和细菌Shannon指数与牧草生产力呈显著正相关,而真菌群落α多样性与牧草生产力呈显著负相关(图1)。

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31f1dfdf5b0211b312b5a7ce6634e953.png图1 微生物群落和牧草群落的α多样性

2. 牧草生产力和多样性与微生物β多样性的关系

不同类群群落(古菌、细菌和真菌)与地理距离之间表现出显著的距离衰减关系,其中,牧草的斜率(β=0.108,P<0.001)显著高于古菌(β=0.054,P<0.001)、细菌(β=0.036,P<0.001)和真菌(β=0.017,P<0.001)。另外,我们发现微生物β多样性与牧草生产力和多样性差异之间也存在显著相关性,随着牧草生产力和多样性差异的增加,微生物物种转化率增加,群落越来越不相似,其中,真菌的斜率最小,其次是细菌和古菌。同时,我们发现土壤变量差异的增加也使得群落越来越不相似。这些结果表明牧草生产力和多样性及土壤变量均与微生物β多样性均存在显著相关关系,但与哪个变量更相关呢?我们利用方差分解的方法进一步确定了牧草多样性和生产力及土壤变量对微生物群落的贡献,结果表明,高寒草地土壤古菌、细菌和真菌群落中,土壤变量的解释率分别为9.30%、10%和10.65%,牧草生产力的解释率分别为11.39%、13.27%和12.92%,牧草多样性的解释率分别为4.92%、4.63%和4.98%。这些结果表明,牧草生产力对微生物群落的贡献高于土壤变量和牧草多样性,表明牧草生产力与微生物群落的相关性更强(图2)。

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bc956594a469ab90d6f9ab5e2d7b709f.png图2 地理距离、草地生产力和多样性、土壤变量与微生物群落之间的相互关系

3. 牧草-微生物跨域生态网络与牧草生产力的关系

323bda596f5aa718185ed4440209ca36.png为了探究天然草地生态系统的IDEN模式,我们构建了微生物与牧草之间以及两个微生物类群之间的二分网络并计算了其网络拓扑属性。与微生物-微生物网络相比,牧草-微生物网络的连接度、聚集系数和嵌套性分别提高了52%,53.4%和41.5%。此外,牧草-微生物网络中所有的连接均为正连接,说明高寒草地牧草与微生物之间是相互共存的。另外,网络的鲁棒性和脆弱性结果表明牧草-微生物网络是复杂且稳定的网络(图3)。Mantel检验了牧草生产力和多样性及土壤变量与网络连通性之间的相关性,结果表明,网络连通性与牧草生产力、多样性之间存在显著相关性,而与土壤变量之间不存在显著相关性(表1)。

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图3 微生物与牧草的网络相互作用

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表1 草地生产力、多样性和土壤变量与牧草-微生物网络连通性的Partial Mantel检验。

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结论

本研究揭示了青藏高原土壤微生物群落与草地草的关系,对促进草地草的可持续发展和草地管理具有重要意义。结果表明,牧草生产力与古菌和细菌α多样性呈正相关,而与真菌α多样性呈负相关。此外,发现随着牧草生产力、多样性和土壤变量差异的增加微生物群落更加不相似,但牧草生产力对于微生物群落的贡献大于牧草多样性和土壤变量,这表明微生物β多样性与牧草生产力相关性更强。IDENs分析表明,牧草与部分细菌、古菌和真菌形成了复杂且稳定的网络,而牧草生产力与网络连通性之间呈显著相关关系。这些结果将有助于我们更好地了解高寒草地生态系统土壤微生物与牧草的相互作用,对建立高寒草地生态系统牧草与微生物的调节机制具有重要意义。

参考文献:

Wang, Y., N. Dang, K. Feng, J. Wang, X. Jin, S. Yao, L. Wang, S. Gu, H. Zheng, G. Lu and Y. Deng (2023). "Grass-microbial inter-domain ecological networks associated with alpine grassland productivity." Frontiers in Microbiology 14.

原文链接:

https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1109128

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中国科学院生态环境研究中心

环境生物技术重点实验室

邓晔 研究员课题组发布

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