Microbiome | 饲料所周志刚组揭示草鱼肠道微生物组功能特征

7f6567bcadd57449eed7a2a35add8e8b.png

https://link.springer.com/article/10.1186/s40168-023-01715-7

近日,中国农业科学院饲料研究所水产微生物与饲料创新团队构建了首个草鱼肠道微生物基因目录,并解析了草鱼肠道微生物组的主要互作模式和功能特征,为鱼类肠道菌群调控提供了理论基础。相关研究成果发表在《微生物组(Microbiome)》上。

84bfbc6f8976da013038368dd4cdbb8b.png

共生微生物可调节养殖鱼类的生长和健康性状,目前对鱼类肠道微生物基因组的了解较少。该研究利用宏基因组学技术,构建了草鱼肠道微生物的非冗余基因目录(57.6万个基因),并对基因目录进行了系统的分类和功能注释。研究发现,草鱼肠道微生物存在两个功能群,二者在生态学上表现为互斥模式,并在与宿主互作方面存在显著差异。进一步发现,两个功能群在碳水化合物利用、毒力因子和抗生素耐药性基因方面均表现出显著的遗传能力差异。研究发现功能群2与功能群1的比值能够有效反映不同饮食下草鱼的肠道微生物群结构及功能特征,该比值可作为评估鱼类肠道菌群稳态的指标。该研究丰富了鱼类肠道微生物的基因目录资源,揭示了鱼类肠道菌群主要门类的功能特征,并提出了肠道菌群调控的潜在靶标。

adae34a3f1c4d475e1da429430ef2351.jpeg

该研究得到国家自然科学基金和中国农业科学院科技创新工程的资助。

https://link.springer.com/article/10.1186/s40168-023-01715-7

da8058a45bf4c6b2d87e44265551c369.gif

来源丨饲料所

作者丨黎明

通讯员丨高鸽

研究发现茶树甲基化儿茶素的生物合成机制

水稻完整参考基因组发布

研究揭示麦蚜唾液蛋白激发小麦防御反应新机制

研究创建丰产减排的稻渔共作新模式

科研人员创建大容量多样化小麦全外显子突变体库

宏基因组推荐

猜你喜欢

iMeta高引文章 fastp 复杂热图 ggtree 绘图imageGP 网络iNAP
iMeta网页工具 代谢组MetOrigin 美吉云乳酸化预测DeepKla
iMeta综述 肠菌菌群 植物菌群 口腔菌群 蛋白质结构预测

10000+:菌群分析 宝宝与猫狗 梅毒狂想曲 提DNA发Nature

系列教程:微生物组入门 Biostar 微生物组  宏基因组

专业技能:学术图表 高分文章 生信宝典 不可或缺的人

一文读懂:宏基因组 寄生虫益处 进化树 必备技能:提问 搜索  Endnote

扩增子分析:图表解读 分析流程 统计绘图

16S功能预测   PICRUSt  FAPROTAX  Bugbase Tax4Fun

生物科普:  肠道细菌 人体上的生命 生命大跃进  细胞暗战 人体奥秘  

写在后面

为鼓励读者交流快速解决科研困难,我们建立了“宏基因组”讨论群,己有国内外6000+ 科研人员加入。请添加主编微信meta-genomics带你入群,务必备注“姓名-单位-研究方向-职称/年级”。高级职称请注明身份,另有海内外微生物PI群供大佬合作交流。技术问题寻求帮助,首先阅读《如何优雅的提问》学习解决问题思路,仍未解决群内讨论,问题不私聊,帮助同行。

点击阅读原文,跳转最新文章目录阅读

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值