MPB | 中科院深圳先进院戴磊组小鼠粪便样本中短链脂肪酸的定量检测-CSDN博客

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小鼠粪便样本中短链脂肪酸的定量检测

Quantitative analysis of short-chain fatty acids (SCFAs) in mouse fecal sample

刘红宾¹^*，汤锦辉¹，戴磊¹

1.中国科学院深圳先进技术研究院，深圳，广东省

*通讯作者邮箱：binhongliu@126.com

引用格式：刘红宾, 汤锦辉, 戴磊. (2020). 小鼠粪便样本中短链脂肪酸的定量检测. // 微生物组实验手册. Bio-101: e2003367. DOI: 10.21769/BioProtoc.2003367.

How to cite: Yunyun Gao, Kai Peng, Defeng Bai, et al. 2024. The Microbiome Protocols eBook initiative: Building a bridge to microbiome research. iMeta 3: e182. https://doi.org/10.1002/imt2.182

摘要：短链脂肪酸（Short-chain fatty acids，SCFAs）是肠道菌群的重要代谢产物，主要包括乙酸、丙酸和丁酸，对宿主的许多生理代谢过程具有有益的调节作用。由于以往检测方法存在操作耗时长、所需样本量大、机器批次效应偏差、前处理误差大的缺点，无法对样本中的SCFAs进行准确定量。本文通过添加内标脂肪酸的方法，可以在1.5小时内完成粪便样本的前处理手动操作，并且只需0.03g的粪便样本，完成对十种SCFAs的定量检测。本方法可拓展至其他生物样品类型（器官组织、微生物培养液等），为肠道菌群代谢相关研究提供技术参考。

关键词：短链脂肪酸，气相色谱-质谱技术，肠道菌群

材料与试剂

材料：

1.0.6 ml离心管

2.气相色谱-质谱上样瓶（Agilent，产品货号： 5181-0714）

3.内插管（Agilent，产品货号：5181-1270）

4.氧化锆珠子（Biospec，产品货号：11079110z）

试剂：

1.SCFAs混合酸标准品（Sigma, 产品货号：CRM46975）

2.6,6,6-d3己酸（cdn isotopes, 产品货号：ND-3993）

3.无水乙醚（上海凌峰）

4.无水Na₂SO4 （Sigma，产品货号：238597）

5.盐酸（上海凌峰）

6.N, O-三甲硅烷基三氟乙酰胺（BSTFA，Sigma，产品货号：25561-30-2）

仪器设备

1.涡旋振荡器（赛默飞，Vortex-Genie 2）

2.低温离心机 (艾本德，5427R)

3.通风橱

4.8890-7000D GC-MS

5.HP-5 ms色谱柱

实验步骤

前期准备工作

按照终浓度配置以下溶液：

1.5 M 盐酸

2.10 µg/ml 6,6,6-d3己酸内标溶液 [1]

3.含有10µg/ml内标的不同梯度浓度SCFAs标准品溶液（25、50、100、200、400、800 μM）

样品前处理

1.取30 mg左右冻存的小鼠粪便于1.5ml离心管内，加入350 µl内标溶液和10 mg左右氧化锆研磨珠。

2.将离心管水平固定在振荡器圆盘上，4 °C环境中10档高速震荡2 min左右进行匀质，直至形成匀浆状态。

3.将振荡器放置于4°C环境中，3档低速震荡30 min。

4.4°C环境中，13,000 x g离心30 min。

5.取100 µl上清至0.6 ml离心管，加入10 µl 5 M盐酸，震荡混匀进行酸化；另取100 µl上清至0.6 ml离心管，标记并于-80 °C冻存备份。

6.加入100 µl无水乙醚，充分震荡混匀，放置冰上5 min [2]。

7.4°C环境中，10,000 x g离心5 min。

8.取上层（乙醚层）至含有10 mg左右无水Na₂SO₄的0.6 ml离心管中。

9.再次加入100 µl无水乙醚至剩余溶液中进行第二次和第三次抽提（重复6-8步2次），将三次抽提的乙醚层抽提溶液混匀震荡，4°C环境中10,000 x g离心3 min。

10.取160 µl离心后的上层乙醚抽提混合液至内插管中，加入8 µl BSTFA震荡混匀。

11.室温静置超过8 h后，上机检测。检测仪器进样、升温等参数见表1，SIM模式下进行靶标脂肪酸的定性和定量检测见表2。

表1. GC-MS上机检测参数设定

项目	参数
进样量	1 μl
分流模式	脉冲分流 (10 psi, 10:1)
隔垫吹扫流速	3ml min⁻¹
载气	氦气
柱流速	1 ml/min
柱箱升温程序	40 °C保持2分钟； 15 °C min⁻¹升温至150 °C，保持1分钟； 30 °C min⁻¹升温至300 °C，保持5分钟
前进样口温度	260 °C
传输线温度	280 °C
离子源温度	230 °C
四级杆温度	150 °C
电离电压	70 eV
采集模式	SIM
溶剂延迟	3.8分钟

表2. SIM模式下SCFA保留时间和定性定量离子

SCFAs	保留时间(min)	定量离子(m/z)	定性离子(m/z)
甲酸	4.1	103	75,103
乙酸	5.03	117	75, 117
丙酸	6.2	131	75, 131
异丁酸	6.71	145	75, 117, 145
丁酸	7.32	145	75, 117, 145
异戊酸	7.94	159	75, 117, 159
戊酸	8.5	159	75, 117, 159
4-甲基戊酸	9.19	173	75, 117, 173
己酸	9.57	173	75, 117, 173
庚酸	10.71	187	75, 117, 187

结果与分析

下图展示了SIM模式下800 μM SCFAs标准品溶液和小鼠粪便样品的检测色谱图（图1）。

图1. SCFAs标准品和小鼠粪便样品在SIM检测模式下的色谱图

参考文献

1.Cai, J., Zhang, J., Tian, Y., Zhang, L., Hatzakis, E., Krausz, K. W., Smith, P. B., Gonzalez, F. J. and Patterson, A. D. (2017). Orthogonal Comparison of GC-MS and (1)H NMR Spectroscopy for Short Chain Fatty Acid Quantitation.Anal Chem 89(15): 7900-7906.

2.Zhang, S., Wang, H. and Zhu, M. J. (2019). A sensitive GC/MS detection method for analyzing microbial metabolites short chain fatty acids in fecal and serum samples.Talanta 196: 249-254.

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